近日，Nature旗下子刊《Scientific data》（2022年IF= 8.501）在線(xiàn)刊發(fā)了題為“The first high-quality chromosomelevel genome of the SipunculaSipunculus nudususing HiFi and Hi-C data”研究論文。廣東海洋大學(xué)為該論文第一單位，水產(chǎn)學(xué)院鄭哲副教授和王慶恒教授分別為文章第一作者和通訊作者。（文章鏈接：https://www.nature.com/articles/s41597-023-02235-7）

星蟲(chóng)動(dòng)物是一類(lèi)具有真體腔、不分節(jié)的古老蠕蟲(chóng)類(lèi)動(dòng)物，在世界分布廣泛，占據(jù)從灘涂到深海的多種生態(tài)位。但在動(dòng)物界的演化地位尚不明確。該論文以具有重要經(jīng)濟(jì)價(jià)值和生態(tài)價(jià)值的光裸星蟲(chóng)（俗稱(chēng)沙蟲(chóng)）為研究對(duì)象，利用HiFi和Hi-C技術(shù)，首次構(gòu)建了星蟲(chóng)動(dòng)物染色體水平的高質(zhì)量基因組圖譜。組裝的光裸星蟲(chóng)基因組大小為1,427Mb，contig N50和scaffold N50長(zhǎng)度分別為29.46Mb和80.87Mb，大約97.91%的基因組序列錨定到17條染色體，注釋到28,749個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因。

光裸星蟲(chóng)的17條組裝染色體的基因組圖

滑動(dòng)窗口：1 Mb；A：已組裝染色體；B：基因密度（0-50）；C：重復(fù)序列含量（0-100%）；D：GC含量（30-45%）；E：測(cè)序深度（30-100×）。

基因組進(jìn)化分析表明星蟲(chóng)動(dòng)物應(yīng)隸屬于環(huán)節(jié)動(dòng)物門(mén)，與多毛類(lèi)擁有共同祖先。同時(shí)，光裸星蟲(chóng)基因組中分別有543個(gè)和97個(gè)顯著擴(kuò)張和收縮的基因家族（P < 0.05），擴(kuò)張的基因家族主要參與細(xì)胞凋亡、解毒、免疫反應(yīng)、氨基酸和脂肪酸代謝、氧化應(yīng)激和能量代謝相關(guān)的通路。該研究不僅有助于了解光裸星蟲(chóng)的進(jìn)化地位和環(huán)節(jié)動(dòng)物門(mén)亞群之間的進(jìn)化關(guān)系，揭示光裸星蟲(chóng)對(duì)不同生活環(huán)境的潛在適應(yīng)機(jī)制和認(rèn)識(shí)冠輪動(dòng)物的系統(tǒng)演化積累重要的基礎(chǔ)資料，還為解析其獨(dú)有的風(fēng)味和豐富營(yíng)養(yǎng)價(jià)值的來(lái)源提供理論依據(jù)。

光裸星蟲(chóng)和其他物種的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)

紅色分支代表環(huán)節(jié)動(dòng)物門(mén)（Annelida），綠色分支代表軟體動(dòng)物門(mén)（Mollusca）