近日，我校水產(chǎn)學(xué)院魚(yú)類(lèi)遺傳育種與增養(yǎng)殖團(tuán)隊(duì)成功構(gòu)建了四指馬鲅（Eleutheronema tetradactylum）的首個(gè)“近端粒到端?！保∟ear T2T）級(jí)高質(zhì)量全基因組圖譜，相關(guān)成果發(fā)表于《Scientific Data》。該成果填補(bǔ)了該物種高精度基因組的空白，為遺傳育種、種質(zhì)保護(hù)和進(jìn)化研究提供了關(guān)鍵的“數(shù)字地圖”。

四指馬鲅（俗稱(chēng)“馬友魚(yú)”“午魚(yú)”）是重要經(jīng)濟(jì)魚(yú)類(lèi)，但此前因缺乏高質(zhì)量基因組，其種群與性狀研究長(zhǎng)期受限，現(xiàn)有版本間隙多、連續(xù)性差，難以滿(mǎn)足育種與功能基因研究需求。為解決這一瓶頸，研究團(tuán)隊(duì)采用PacBio HiFi高保真測(cè)序、Oxford Nanopore超長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序與Hi-C技術(shù)相結(jié)合的策略，實(shí)現(xiàn)高準(zhǔn)確度與長(zhǎng)片段拼接優(yōu)勢(shì)互補(bǔ)。新構(gòu)建的基因組全長(zhǎng)585.38 Mb，Contig N50達(dá)22.14 Mb，98.76%的序列成功錨定到26條染色體。值得關(guān)注的是，其中10條染色體實(shí)現(xiàn)了真正的端粒到端粒（T2T）無(wú)間隙組裝，在魚(yú)類(lèi)基因組研究中極具先進(jìn)性。BUSCO評(píng)估得分高達(dá)99.53%，表明該基因組在完整性和組裝質(zhì)量上均處于國(guó)際領(lǐng)先水平，是目前該物種質(zhì)量最高的參考基因組。

該高質(zhì)量基因組具有重要的產(chǎn)業(yè)與生態(tài)價(jià)值：一方面可精準(zhǔn)支撐生長(zhǎng)、抗病等關(guān)鍵性狀基因挖掘，顯著提升分子育種效率；另一方面為解析種群遺傳結(jié)構(gòu)和制定保護(hù)策略提供科學(xué)依據(jù)。

未來(lái)，團(tuán)隊(duì)將基于此開(kāi)展性狀關(guān)聯(lián)分析和功能驗(yàn)證，并與國(guó)內(nèi)外科研機(jī)構(gòu)和企業(yè)合作推進(jìn)分子育種與資源保護(hù)，助力漁業(yè)綠色發(fā)展。